PMC 通过云服务为不同的 PMC 文章数据集提供文件访问。这些文件包括元数据（JSON格式）、文章全文（NISO Z39.96-2015 JATS XML格式）、从XML中提取的纯文本全文，以及在可用时提供的全文章PDF、媒体文件和补充材料。关于作者手稿（Author Manuscript）和开放获取子集（Open Access Subset）的区别，资料指出：
* **PMC Open Access Subset**：该子集中的文章可根据出版商指定的条款进行重用，其中大多数可用的文章具有机器可读的知识共享许可（Creative Commons licenses）。
* **Author Manuscript Dataset**：该完整作者手稿数据集包括在 PMC 中根据资助方政策收集的文章，并以机器可读的格式提供，可用于文本挖掘。需要注意的是，带有知识共享许可的作者手稿也属于 PMC Open Access Subset 的一部分。
关于部分无 CC 许可的手稿不包含 PDF 或媒体文件的问题，资料中明确说明了限制条件：**“NOTE: PDFs, Media files and supplementary materials for author manuscripts without Creative Commons licenses are NOT made available as part of the PMC Article Datasets.”** 这表明，对于没有知识共享许可的作者手稿，其 PDF、媒体文件和补充材料不会作为 PMC 文章数据集的一部分提供。
此外，PMC 还提供了一个每日更新的 CSV 目录文件，该文件保存 30 天。